MultiGeneBlast
| Versija | 1.1.5 |
|---|---|
| Izdevējs | MultiGeneBlast |
| Izdošanas datums | 2013. gada 3. apr. |
| Pievienošanas datums | 2013. gada 4. apr. |
| OS prasības | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Prasības | None |
| Kopējais lejupielāžu skaits | 95 |
| Cena | Free |
Apraksts
MultiGeneBlast ir atvērtā pirmkoda rīks, kura pamatā ir NCBI GenBank proteīna ierakstu FASTA galveņu pārformatēšana, ar kuras palīdzību tas var izsekot to avota nukleotīdu un koordinātas. MultiGeneBlast var palīdzēt noteikt šādas daudzgēnu daļas sintētiskās bioloģijas projektos. Pamatojoties uz tās izvadi, var izveidot sintētisko operonu bibliotēku, lai identificētu tos operonus, kuru funkcija ir vistuvākā lietotāja vēlamajai. Šis rīks nodrošina iespēju identificēt visus homologos genoma reģionus, apvienojot katra gēna atsevišķu BlastP palaišanas rezultātus un šķirojot genoma reģionus no jebkura GenBank ieraksta pēc trāpījumu skaita, sintēzes saglabāšanas un kumulatīvā Blast bitu rezultāta. Arhitektūras meklēšanu var veikt, lai atrastu jebkurus genoma reģionus ar Blast trāpījumiem jebkurai lietotāja norādītai aminoskābju secību kombinācijai.
