GenoSuite
| Versija | 2.0.1 |
|---|---|
| Izdevējs | Dhirendra Kumar |
| Izdošanas datums | 2013. gada 2. maijs |
| Pievienošanas datums | 2013. gada 2. maijs |
| OS prasības | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Prasības | None |
| Kopējais lejupielāžu skaits | 22 |
| Cena | Free |
Apraksts
GenoSuite ir ietvars, kas izstrādāts proteogenomiskai analīzei. Uz FDRScore balstīta stratēģija tiek izmantota, lai integrētu rezultātus no vairākiem meklēšanas algoritmiem. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) ir izstrādāts kā daļa no GenoSuite sistēmas. PPT ir paredzēts jaunu tulkojumu atrašanai prokariotu genomos un ir atkarīgs no masas spektrometrijas proteomikas datiem un saistītās genoma secības. Funkcijas ietver konfigurāciju 4 atvērtā koda algoritmiem, lai veiktu peptīdu identifikācijas meklēšanu datu bāzē, un var izvēlēties jebkuru 4 algoritmu kombināciju, uzskaitīti genoma meklēšanai specifiskie peptīdi (jaunie peptīdi), spektrālās atbilstības var vizualizēt kvalitātes novērtēšanai, uzskaitītas. var izveidot arī jaunos proteīnus un izmaiņas esošajās proteīnu anotācijās, kā arī jauno peptīdu vizuālo genoma kontekstu.
