AmplifX for Mac 2.0b

AmplifX operētājsistēmai Mac — galvenais primer pārvaldības rīks molekulārajiem biologiem

Ja esat molekulārais biologs, jūs zināt, cik svarīgi ir, lai jūsu rīcībā būtu pareizie primeri. Šie mazie DNS gabali ir būtiski specifisku secību pastiprināšanai mērķa DNS paraugā, un tie var izraisīt vai izjaukt jūsu eksperimentus. Bet gruntskrāsu kolekcijas pārvaldīšana var būt biedējošs uzdevums, it īpaši, ja jūsu ledusskapjos glabājas simtiem vai pat tūkstošiem to.

Šeit darbojas AmplifX. Šis jaudīgais programmatūras rīks ir īpaši izstrādāts molekulārbiologiem, kuriem ir nepieciešams efektīvi un produktīvi pārvaldīt savas primer kolekcijas. Izmantojot AmplifX, varat viegli meklēt savā primeru kolekcijā, lai atrastu tos, kas ir vispiemērotākie jūsu eksperimentiem. Varat arī izstrādāt jaunus primerus lidojuma laikā, izmantojot uzlabotus algoritmus, kas ņem vērā tādus faktorus kā kušanas temperatūra (TM), kvalitāte un garums.

Taču AmplifX nav tikai primeru pārvaldīšana – tā ir arī stratēģiju izstrāde rekombinanto klonu skrīningam ar PCR. Tas nozīmē, ka varat izmantot AmplifX, lai noteiktu, kuri kloni satur mērķa secību, kuras pastiprināšana jūs interesē, ietaupot laiku un pūles salīdzinājumā ar tradicionālajām skrīninga metodēm.

Viena no galvenajām AmplifX funkcijām ir tā spēja automātiski aprēķināt noteiktu informāciju par katru jūsu kolekcijas primeru. Piemēram, tas var aprēķināt TM vērtības, pamatojoties uz primer secību un citiem parametriem, piemēram, sāls koncentrāciju un atkvēlināšanas temperatūru. Tas var arī novērtēt gruntējuma kvalitāti, pamatojoties uz tādiem faktoriem kā GC saturs un sekundārās struktūras veidošanās.

Protams, ne visa informācija par katru primeri tiks aprēķināta automātiski – daļa lietotājam būs jāievada manuāli. Taču ar AmplifX intuitīvo saskarni un lietotājam draudzīgo dizainu šis process ir ātrs un vienkāršs.

Vēl viena lieliska AmplifX īpašība ir tā spēja pārvaldīt gan secības (in silico), gan īstas lampas (in vivo). Tas nozīmē, ka varat izsekot ne tikai tam, kuri gruntskrāsas kur tiek glabāti, bet arī to, kuri no tiem jau ir izmantoti vai vēl ir jāpārbauda pirms lietošanas.

Kopumā, ja meklējat efektīvu veidu, kā pārvaldīt savu molekulārās bioloģijas primeru kolekciju, vienlaikus viegli veidojot jaunus, meklējiet tikai Amplifx!